{"id":6935,"date":"2026-05-13T17:47:14","date_gmt":"2026-05-13T15:47:14","guid":{"rendered":"https:\/\/prezode-initiative.org\/rongeurs-et-hantavirus-surveiller-pour-prevenir\/"},"modified":"2026-05-22T17:47:34","modified_gmt":"2026-05-22T15:47:34","slug":"rongeurs-et-hantavirus-surveiller-pour-prevenir","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/prezode-initiative.org\/fr\/rongeurs-et-hantavirus-surveiller-pour-prevenir\/","title":{"rendered":"Rongeurs et hantavirus : surveiller pour pr\u00e9venir"},"content":{"rendered":"\n
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La crise de l’hantavirus Andes rappelle les d\u00e9fis pos\u00e9s par les infections d’origine animale \u00e0 potentiel \u00e9pid\u00e9mique, et la n\u00e9cessit\u00e9 de renforcer la pr\u00e9vention, la surveillance et la d\u00e9tection des agents pathog\u00e8nes zoonotiques. Discussion avec \u00c9lodie Monchatre-Leroy, responsable de l’\u00e9quipe du projet RatSWIM (PEPR PREZODE). <\/strong><\/h2>\n\n
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Le projet PEPR PREZODE RatSWIM vise \u00e0 \u00e9valuer si les pathog\u00e8nes port\u00e9s par les rats (Rattus norvegicus) sont d\u00e9tectables dans les eaux us\u00e9es et peuvent faire l\u2019objet d\u2019une surveillance via ces eaux us\u00e9es. Le projet cherche \u00e0 faire la preuve de ce concept pour quatre pathog\u00e8nes zoonotiques. Des rats sont captur\u00e9s dans les \u00e9gouts et des eaux us\u00e9es sont pr\u00e9lev\u00e9es simultan\u00e9ment au m\u00eame endroit, afin d\u2019essayer de corr\u00e9ler la contamination des deux matrices. <\/p>\n\n
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\u00c9lodie Monchatre-Leroy est la responsable de l\u2019\u00e9quipe du projet RATSWIM. V\u00e9t\u00e9rinaire de formation, elle a consacr\u00e9 sa th\u00e8se universitaire \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9miologie des hantavirus chez les rongeurs dans l’Est de la France. Sp\u00e9cialiste en virologie, elle s’int\u00e9resse plus particuli\u00e8rement aux r\u00e9servoirs de la faune sauvage. Apr\u00e8s avoir dirig\u00e9 pendant quatorze ans le laboratoire Rage et Faune Sauvage de l’ANSES, elle est aujourd’hui enseignante-chercheuse en infectiologie \u00e0 UniLaSalle, rattach\u00e9e \u00e0 l\u2019unit\u00e9 de recherche IDEALISS. <\/p>\n<\/div><\/div>\n\n
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Quelles maladies infectieuses pour l\u2019homme les rongeurs sont-ils susceptibles de v\u00e9hiculer ? Lesquelles sont les plus \u00e0 risque pour l\u2019homme ? <\/strong><\/h3>\n\n
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Avec les chiropt\u00e8res, les rongeurs figurent parmi les ordres d’animaux les plus impliqu\u00e9s dans la transmission de maladies \u00e0 l’homme. Ils constituent un r\u00e9servoir pour de nombreuses pathologies bact\u00e9riennes \u2014 comme la peste, encore pr\u00e9sente dans certaines r\u00e9gions du monde, ou la leptospirose \u2014 et virales, notamment les hantavirus et le HEV (Rocahepevirus ratti), le virus de l’h\u00e9patite du rat. Celui-ci a longtemps \u00e9t\u00e9 consid\u00e9r\u00e9 comme non zoonotique mais des cas humains \u00e9mergent peu \u00e0 peu, avec une atteinte h\u00e9patique. <\/p>\n\n
Chaque hantavirus est associ\u00e9 \u00e0 un r\u00e9servoir animal bien pr\u00e9cis. En France, deux hantavirus dits \u00ab de l\u2019Ancien Monde \u00bb circulent principalement. Le virus Seoul a pour r\u00e9servoir Rattus norvegicus, le rat brun ou surmulot, pr\u00e9sent en particulier dans les villes. Le virus Puumala, lui, a pour r\u00e9servoir le campagnol rouss\u00e2tre (Clethrionomys glareolus). Les infections par ces deux hantavirus sont appel\u00e9es fi\u00e8vre h\u00e9morragique \u00e0 syndrome r\u00e9nal ou FHSR. Elles sont de gravit\u00e9 variable, allant de l\u2019absence de sympt\u00f4mes ou d\u2019un syndrome grippal plus ou moins s\u00e9v\u00e8re \u00e0 une insuffisance r\u00e9nale. Le taux de l\u00e9talit\u00e9 du Puumala virus Puumala est estim\u00e9 \u00e0 moins de 1% et celui du virus S\u00e9oul \u00e0 10% au maximum. Ces deux hantavirus ne se transmettent pas entre humains. <\/p>\n\n
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\u00ab\u00a0Pygmy\u00a0\u00bb rat -Oligoryzomys sp-, known to be reservoir of hantavirus Andes<\/strong><\/em><\/p>\n<\/div><\/div>\n\n
Les hantavirus dits \u00abdu Nouveau Monde \u00bb circulent sur le continent am\u00e9ricain. On y trouve notamment le virus Andes, v\u00e9hicul\u00e9 par un rat \u00ab pygm\u00e9e \u00bb (Oligoryzomys sp.), et le virus Sin Nombre (\u00ab sans nom \u00bb en espagnol), dont le r\u00e9servoir est Peromyscus maniculatus. Ces hantavirus peuvent donner lieu \u00e0 une transmission interhumaine, vraisemblablement par voie respiratoire compte tenu de leur tropisme cardio-pulmonaire. Cette transmission n’est cependant pas comparable \u00e0 celle d’un coronavirus : elle n\u00e9cessite un contact plus rapproch\u00e9 et prolong\u00e9 . <\/p>\n\n
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Il est important de ne pas se focaliser sur un seul hantavirus, et de rester prudent dans les g\u00e9n\u00e9ralisations.<\/p>\n<\/blockquote>\n\n
D’autres hantavirus circulent par ailleurs en Europe et en France, mais leur symptomatologie reste mal connue : ils ont \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9s dans la faune sauvage sans que l’on sache pr\u00e9cis\u00e9ment ce qu’ils peuvent provoquer chez l’humain. Comme pour tout virus, des variations existent pour chaque esp\u00e8ce virale qui peut \u00e9voluer au cours du temps : il est important de rester prudent dans les g\u00e9n\u00e9ralisations. <\/p>\n\n
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Quels sont les facteurs qui, selon vous, favorisent le plus l\u2019interface entre les rongeurs porteurs de hantavirus et les hommes ?<\/strong><\/h3>\n\n
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Chez le rongeur, l’infection est a priori asymptomatique : l’animal se porte tr\u00e8s bien et excr\u00e8te le virus, notamment par les urines et les f\u00e8ces. La contamination humaine se fait par inhalation des poussi\u00e8res mises en suspension. Pour le Puumala, elle se produit typiquement en for\u00eat \u2014 en balayant une cabane de chasse, en travaillant le bois ou en manipulant un tas de b\u00fbches habit\u00e9 par des rongeurs. D\u00e8s lors que les rongeurs pullulent et sont infect\u00e9s, l’exposition virale augmente, et toute personne fr\u00e9quentant ces milieux peut \u00eatre contamin\u00e9e. C’est ainsi qu’aux \u00c9tats-Unis, le virus Sin Nombre a \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9 dans les ann\u00e9es 1990 dans une r\u00e9serve am\u00e9rindienne, \u00e0 la suite de fortes pluies ayant entra\u00een\u00e9 une v\u00e9g\u00e9tation abondante, puis une pullulation de rongeurs infect\u00e9s et un nombre important de cas humains. <\/p>\n\n
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Chaque hantavirus est associ\u00e9 \u00e0 un r\u00e9servoir animal bien pr\u00e9cis. \u00c0 date, un seul hantavirus a un potentiel de transmission interhumaine. <\/p>\n<\/blockquote>\n\n
Les facteurs de transmission sont \u00e9minemment variables, car la pullulation des rongeurs d\u00e9pend elle-m\u00eame de facteurs environnementaux \u2014 m\u00e9t\u00e9o, abondance de nourriture, paysage. Ces cycles d’abondance s’accompagnent de dynamiques propres \u00e0 la circulation du virus. Lorsque la population de rongeurs est stable, l’infection l’est aussi : les animaux tol\u00e8rent leur virus et l’excr\u00e8tent moins. \u00c0 l’inverse, dans les zones o\u00f9 la population est mobile et brass\u00e9e, des variants viraux diff\u00e9rents peuvent atteindre des rongeurs peu familiers de ces souches, entra\u00eenant des explosions d’infections \u2014 et davantage de contaminations humaines. <\/p>\n\n
Les facteurs de risque d\u00e9pendent enfin des activit\u00e9s humaines et de l’esp\u00e8ce r\u00e9servoir. Le virus Seoul fait exception : transmis par le rat brun, rongeur urbain, il peut occasionner des contaminations en ville, dans des logements mal entretenus ou dans des parcs. Les cas humains d\u2019infection au S\u00e9oul virus sont rares en France. <\/p>\n\n
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Le projet de recherche que vous animez, RATSWIM, litt\u00e9ralement \u00ab \u00c9valuation des Rongeurs dans les \u00c9gouts et Stations d’\u00e9puration \u2013 Impact sur les Mammif\u00e8res R\u00e9servoirs \u00bb, s\u2019attache \u00e0 la surveillance primaire des modes de contamination, notamment via les eaux us\u00e9es. Pouvez-vous nous l\u2019exposer ? <\/strong><\/h3>\n\n
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Avant RatSWIM, l’\u00e9quipe travaillait sur un projet nomm\u00e9 RATVAR[1], qui visait \u00e0 comprendre si le SARS-CoV-2 dont le g\u00e9nome est d\u00e9tect\u00e9 dans les eaux us\u00e9es pouvait contaminer Rattus norvegicus vivant dans les \u00e9gouts. L’arriv\u00e9e du variant Omicron \u2014 accompagn\u00e9e d’un \u00e9ventuel changement de tropisme \u2014 soulevait la question d’un \u00e9ventuel passage du virus chez ces rongeurs. Il \u00e9tait important de v\u00e9rifier qu’ils ne devenaient pas un r\u00e9servoir animal, ce qui aurait \u00e9t\u00e9 particuli\u00e8rement pr\u00e9occupant. Le projet a d\u00e9montr\u00e9 que non, et les r\u00e9sultats ont \u00e9t\u00e9 publi\u00e9s (Beissat et al., 2025, https:\/\/doi.org\/10.1371\/journal.pone.0316882). RATVAR avait \u00e9galement permis de d\u00e9tecter d’autres pathog\u00e8nes infectant les rats : le virus Seoul (hantavirus), les leptospires, le HEV (virus de l’h\u00e9patite du rat). <\/p>\n\n
RatSWIM s’inscrit dans cette continuit\u00e9 : il s’agit de v\u00e9rifier si les eaux us\u00e9es peuvent servir d’outil de surveillance des pathog\u00e8nes zoonotiques circulant chez les rats, la capture syst\u00e9matique des rongeurs \u00e9tant logistiquement impossible \u00e0 l’\u00e9chelle d’une v\u00e9ritable surveillance. La preuve de concept porte sur quatre pathog\u00e8nes (Seoul, leptospires, HEV, poxvirus). Des rats sont captur\u00e9s et des eaux us\u00e9es pr\u00e9lev\u00e9es simultan\u00e9ment au m\u00eame endroit, afin d\u2019essayer de corr\u00e9ler la contamination des deux matrices. . Une \u00e9tape de normalisation est \u00e9galement test\u00e9e, en recherchant de l’ADN de rats dans les eaux us\u00e9es pour estimer la taille des populations. <\/p>\n\n
Le projet se concentre sur la ville de Lyon, en partie pour des raisons d’acc\u00e8s \u2014 la descente dans les \u00e9gouts est strictement encadr\u00e9e. Une observation issue de RATVAR a renforc\u00e9 l’int\u00e9r\u00eat du dispositif : les rats captur\u00e9s en surface pr\u00e9sentent une s\u00e9ropr\u00e9valence nettement plus faible que ceux captur\u00e9s dans les \u00e9gouts pour le HEV et les leptospires.. Cela sugg\u00e8re que les eaux us\u00e9es pourraient elles-m\u00eames constituer un facteur de risque de contamination, en facilitant la circulation des pathog\u00e8nes entre rongeurs. <\/p>\n\n
Aujourd’hui, les captures de rats ont d’ores et d\u00e9j\u00e0 commenc\u00e9. Les \u00e9quipes travaillent \u00e0 la mise au point des techniques de d\u00e9tection des poxvirus et des leptospires, ainsi qu’\u00e0 la caract\u00e9risation du HEV, le moins connu des quatre pathog\u00e8nes. La mise en culture a \u00e9t\u00e9 men\u00e9e \u00e0 bien, mais il reste \u00e0 d\u00e9velopper des outils g\u00e9nomiques permettant de d\u00e9terminer si le virus d\u00e9tect\u00e9 est entier et infectieux. En parall\u00e8le, la mise au point des technique de d\u00e9tection d’ADN de rats dans les eaux us\u00e9es est \u00e9galement en cours, afin d’estimer la taille des populations de rongeurs sur les sites \u00e9tudi\u00e9s. <\/p>\n\n
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RATSWIM est un des 11 projets du PEPR PREZODE, un des programmes cl\u00e9s de la strat\u00e9gie nationale France 2030 \u00ab maladies infectieuses \u00bb. Pouvez-vous expliquer les objectifs du PEPR et sa compl\u00e9mentarit\u00e9 avec le PEPR MIE ? <\/strong><\/h3>\n\n
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RatSWIM est l’un des projets du PEPR PREZODE , financ\u00e9 par France 2030 via l’ANR (Agence nationale de la recherche , France). Il porte sur la pr\u00e9vention primaire des pathog\u00e8nes zoonotiques \u00e9mergents ou r\u00e9\u00e9mergents \u00e0 potentiel pand\u00e9mique (y compris le pathog\u00e8ne X), en amont du spillover vers l’humain. <\/p>\n\n
Ce programme est compl\u00e9mentaire du PEPR MIE (Maladies Infectieuses \u00c9mergentes), port\u00e9 par l’ANRS MIE, d\u00e9di\u00e9 \u00e0 la pr\u00e9paration et r\u00e9ponses aux crises sanitaires et \u00e0 de nouveaux outils de pr\u00e9vention et de contr\u00f4le (vaccins, diagnostics, traitements). Ancr\u00e9s dans l’approche One Health, ces deux PEPR sont compl\u00e9mentaires : ils couvrent des \u00e9tapes distinctes du continuum d’\u00e9mergence, en amont et en aval des contaminations chez l\u2019humain, en int\u00e9grant syst\u00e9matiquement les sciences humaines et sociales.Le projet RATSWIM est l\u2019exemple parfait de la compl\u00e9mentarit\u00e9 entre ces deux programmes. Il va apporter des preuves scientifiques permettant de mieux d\u00e9tecter le risque zoonotique li\u00e9 aux rats vivant \u00e0 proximit\u00e9 des humains, Il contribuera \u00e0 am\u00e9liorer la d\u00e9tection pr\u00e9coce des risques d\u2019\u00e9mergence et \u00e0 orienter des strat\u00e9gies de pr\u00e9vention plus efficaces. Les connaissances g\u00e9n\u00e9r\u00e9es permettront \u00e9galement de mieux \u00e9clairer les besoins en mati\u00e8re de pr\u00e9paration et de r\u00e9ponse face aux futures crises sanitaires. <\/p>\n\n
Le projet associe des chercheurs de l\u2019ANSES, de l\u2019Institut Pasteur, du l\u2019Institut de Recherche Biom\u00e9dicale des Arm\u00e9es, du LCPME du R\u00e9seau obepine+, du CNR, de VetAgroSup et d\u2019UniLasalle.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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